| Case | Singular | Plural |
|---|---|---|
| nom | mikroorganismus | mikroorganismy |
| gen | mikroorganismu | mikroorganismů |
| dat | mikroorganismu | mikroorganismům |
| acc | mikroorganismus | mikroorganismy |
| voc | mikroorganisme | mikroorganismy |
| loc | mikroorganismu | mikroorganismech |
| instr | mikroorganismem | mikroorganismy |